U prvom kolu igra 16 najuspješnijih klubova iz županijskih nogometnih saveza (klubovi općinske lige, županijske lige i Druge lige FBiH).
Shodno obavljenom žrijebu u prvom kolu završnice seniorskog Kupa Federacije BiH sastaju se:
FK Unis Vogošća- NK Kolina Ustikolina
FK Pofalićki Sarajevo- NK Fortuna/FK Rudar Breza
NK Stupčanica Olovo- NK Kiseljak
NK Krajišnik V. Kladuša- NK Romari Vitez
FK Bukovik G. Srebrenik- FK Dizdaruša Brčko
NK Odžak 102/NK Dinamo – FK Radnički Lukavac
HNK Neum – NK Ljubuški
FK Klis B. Polje – HNK Sloga G. Vakuf/Uskoplje
Utakmice prvog kola završnice seniorskog Kupa FBiH igraju se 26.08.2020. godine u 17:00 sati.
U drugom kolu završnice Kupa Federacije BiH učestvuje 24 kluba. Od toga učestvuje 16 klubova članova m:tel Prve lige Federacije BiH u takmičarskoj sezoni 2020/2021, te osam najuspješnijih klubova pobjednika utakmica prvog kola.
Voljom žrijeba u drugom kolu završnice seniorskog Kupa Federacije BiH sastaju se:
FK Unis/NK Kolina – NK Jedinstvo Bihać
FK Pofalićki-NK Fortuna/FK Rudar (B) – NK Slaven Živinice
NK Stupčanica/NK Kiseljak – NK Gošk Gabela
NK Krajišnik/NK Romari – FK Goražde
FK Bukovik/FK Dizdaruša – HŠK Posušje
NK Odžak 102-NK Dinamo/FK Radnički Lukavac – HNK Čapljina
HNK Neum/NK Ljubuški – FK Budućnost Banovići
FK Klis/HNK Sloga – NK Bratstvo Gračanica
NK Tošk Tešanj – NK Zvijezda Gradačac
HNK Orašje – NK Travnik
FK Rudar Kakanj – FK Radnik Hadžići
FK Igman Konjic – NK Vis Simm Bau Kosova
Utakmice drugog kola završnice seniorskog Kupa FBiH igraju se 16.09.2020. godine u 16:30 sati.